Docker posee un bug, crece el aufs filesystem hasta que nos quedamos sin espacio en nuestro disco, para solucionar esto debemos correr las siguiente lineas:
Denetemos el servicio de docker
systemctl stop docker
Borramos el contenido del directorio aufs
rm -rf /var/lib/docker/aufs
Elimina todos los paquetes del cache
apt-get autoclean -y
Borra los paquetes huérfanos, o las dependencias
apt-get autoremove -y
Iniciamos el servicio de docker
systemctl start docker